暗影之魂是困难模式下的重要制作材料，主要用于合成包括新三王召唤物在内的多种高级装备与道具。要获取它，首先必须击败肉山魔王，使世界进入困难模式。在此你需要深入世界的地下部分，找到特定的腐化之地或猩红之地生物群落，并且只有在洞穴层及其更深的深度，击杀其中的怪物才有机会掉落暗影之魂。
暗影之魂并非由某个特定怪物独有掉落，而是由处于地下腐化之地或地下猩红之地环境中的大部分敌怪均有几率掉落。这意味着只要满足该环境条件，你击杀诸如腐化者、腐化史莱姆等常见的腐化生物，甚至是不专属于该生物群落但刚好在此处生成的敌怪，都有机会获得。这个掉落几率通常为五分之一，即百分之二十，是一个相对可观的概率，但也需要一定的耐心。
除了腐化之地的常见怪物，一些更强大的特定敌怪也被认为是暗影之魂的可靠来源。例如在地牢环境中出现的黑暗投弹手，在深渊区域徘徊的丧魂夜鬼，以及体型巨大、实力强悍的暗影巨魔，击败它们都有几率收获暗影之魂。在超硬模式中出现的恶魔之眼，以及仅在特定夜晚事件中出现的特殊怪物暗影兔兔，同样属于可能掉落暗影之魂的敌怪范畴。
为了提高获取效率，玩家可以采取一些针对性的方法。一种常见的策略是主动建造或改造环境，在洞穴层深处，通过铺设足够数量的腐化或猩红物块，人工制造一个符合条件的刷怪场。这样可以集中并高效地生成符合条件的敌怪，从而提升收集暗影之魂的速度。利用某些具有多节身体的Boss级敌怪，在特定环境中召唤并击败它，其每一节身体的死亡都可能被视作一次独立的击杀判定，从而在一次战斗中提供多次掉落机会。因其是合成机械骷髅王、机械魔眼、机械蠕虫等机械Boss召唤物，以及诸多强力武器的核心材料，所以收集足够的暗影之魂对于推进困难模式游戏进程至关重要。
