秘卷是每个忍者都不可或缺的独特技能系统，能提供攻击、防御或辅助等多种效果。获取秘卷的基础途径是每天必刷的小队突袭玩法，每次通关可以获得2个秘卷碎片，建议每天前三局开启3倍奖励，这样每场能获得8个碎片，不仅加快收集速度，还能提高稀有碎片的爆率。每周限购的金币礼包和组织乞讨也能补充碎片，但新手最好优先用小队突袭稳定积累。
秘卷系统主要分为攻击型、防御型和辅助型三大类别，其中攻击型如风遁·风杀阵和火遁·烈炎弹，能直接造成高额伤害；防御型如霸体和冰遁·冻雪，提供护盾或控制效果；辅助型则包括气旋和查克拉等，用于干扰对手或强化自身。目前决斗场中较多人使用的秘卷有风遁·风沙阵、冰遁·冻雪和禁术·阴愈伤灭等，这些秘卷在实战中表现稳定，适合新手优先升级使用。
搭配秘卷时需要结合忍者的特性来选择，例如爆发型忍者适合携带查克拉秘卷来刷新技能，消耗型忍者则推荐气旋或冻雪来限制走位，反手型忍者搭配霸体可以避免控制并实现反击。生存型忍者如小南等则需要保命型秘卷来延长生存时间，确保在决斗场中能灵活应对不同局面。
在决斗场中使用秘卷要把握好节奏，例如在对手替身后或自身血量危险时及时释放，能有效打断连招或创造反击机会。秘卷的释放通常在Y轴移动时更容易命中对手，因为多数玩家会忽视上下走位。秘卷的冷却时间较长，不要随意浪费，建议在关键时刻如控制对手或躲避技能时使用，这样能最大化秘卷的效用。
秘卷的等级会直接影响在决斗场中的实用效果，等级越高，伤害或控制能力越强。升级秘卷需要积累碎片，新手可以先集中资源将常用秘卷提升到一定等级，再逐步平衡其他类型，避免单一强化导致整体战术失衡。
